AAS, çevre bilimleri, yiyecek ve içecek, kimya ve ilaç sektörlerinde çok çeşitli numune türlerinin iz metal analizi için safsızlık veya kontaminasyon izleme ve kalite kontrolünün yanı sıra hammaddelerin hızlı değerlendirilmesi için yaygın olarak kullanılmaktadır. Ayrıca kan ve idrar gibi biyolojik sıvıların analizi için klinik bir ortamda kullanılır.